生物质锅炉除尘器的结构比较好，而且使用寿命长，它的含尘气体由进风口进入，经过灰斗时，气体中部分大颗粒粉尘受惯性力和重力作用被分离出来，直接落入灰斗底部。含尘气体通过灰斗后进入中箱体的滤袋过滤区，气体穿过滤袋，粉尘被阻留在滤袋外表面，净化后的气体经滤袋口进入上箱体后，再由出风口排出。
随着生物质锅炉除尘器过滤时间的延长，滤袋上的粉尘层不断积厚，除尘设备的阻力不断上升，当设备阻力上升到设定值时，清灰装置开始进行清灰。我们要先将一个分室的提高阀关闭，将过滤气流截断，然后电磁脉冲阀开启，压缩空气以较短促的时间在上箱体内迅速膨胀，涌入滤袋，使滤袋膨胀变形产生振动，并在逆向气流冲刷的作用下，附着在滤袋外表面上的粉尘被剥离落入灰斗中。清灰完毕后，电磁脉冲阀关闭，提高阀打开，该室又恢复过滤状态。清灰各室依次进行，从一室清灰开始至下一次清灰开始为一个清灰周期。
生物质锅炉除尘器的方案可以适用于各种不同型号的生物质锅炉除尘器，然后在采用二级除尘方式，即锅炉烟气要先通过陶瓷多管旋风除尘器或者阻火器，然后进入布袋除尘器。采用了旋风处理器和火花捕集器能炽热飞灰直接进入布袋烧坏布袋的情况发生，减少尘进入布袋除尘器的粉尘量，有利于减轻磨损，延长布袋使用寿命。
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