他曾在釜山亚运会上包揽200米蝶泳、200米仰泳和400米个人混合泳三项冠军，在赛场上“一打响”，曾在密歇根大奖赛男子200米蝶泳决赛中，首次战胜菲尔普斯，勇夺冠军。
2005年十运会男子4×200米泳接力名、男子200米蝶泳名、男子400米个人混合泳名、男子4×100米泳接力名、男子100米蝶泳第二名、男子200米个人混合泳第二名
2011年美国游泳大奖赛印第安纳波利斯站200米蝶泳第三名2011年4月10日美国密歇根游泳大奖赛200米蝶泳决赛冠军（1分56秒62吴鹏次在直接较量中击败菲尔普斯）5月14日美国夏洛特站游泳大奖赛，在男子200米蝶泳决赛中，吴鹏第二次战胜菲尔普斯，夺得该项目的冠军。7月27日2011年第14届（上海）世界游泳锦标赛夺取200米蝶泳季军。
吴鹏选择游泳纯属偶然，五岁时体重超标，篮球运动员出身的父母一心想找一种运动帮小吴鹏减肥，正巧遇上邻居一同龄孩子在公园溺水身亡。于是吴妈妈二话不说把儿子送进了游泳训练班。吴鹏从此与游泳结缘。初，吴鹏对游泳可用“厌恶”两字形容。每次老师把他扔进水里，他一边挣扎一边哭。每天这样折腾，很累还呛很多水，所以每天小吴鹏都哭着闹着要放弃，可是妈妈一直在坚持。直到1996年，情况发生了变化。连续多次获奖，让年仅9岁的吴鹏产生了成就感，由此对游泳的态度也由厌恶转变为喜欢。此后就不需要妈妈监督，与生俱来的运动天赋，加上自觉努力，全身心投入训练让吴鹏像火箭蹿升，全运会、亚运会，他一次次创造惊喜。此后，顺利进入国家队，小小年纪成了中国游泳的新希望，这让吴鹏信心倍增。
经历大大小小的比赛，吴鹏成了中国泳坛真正的领军人物，而他也将目光投向了更广阔的世界舞台。